小鼠NFATc1相互作用蛋白功能及KEGG通路分析
關(guān)鍵詞：go富集分析 kegg信號(hào)通路 david
摘要：目的:利用生物信息學(xué)方法對(duì)小鼠NFATc1及相關(guān)蛋白功能進(jìn)行預(yù)測(cè)與分析,為探討NFATc1生物學(xué)功能及作用機(jī)制提供借鑒。方法:利用在線數(shù)據(jù)庫(kù)STRING,選取系統(tǒng)打分高于0.800的20種蛋白質(zhì)與NFATc1構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,并對(duì)該蛋白集合進(jìn)行后續(xù)分析;采用DAVID在線分析工具對(duì)以上蛋白進(jìn)行GO功能富集和KEGG信號(hào)通路分析。結(jié)果:GO富集分析顯示,該蛋白集合參與CaN/NFAT信號(hào)通路、轉(zhuǎn)錄正調(diào)控、JUN蛋白磷酸化、基因表達(dá)正調(diào)控等生物學(xué)過程。具體分子功能主要是結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子、鈣依賴蛋白絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶活性、JUN蛋白激酶活性及RNA聚合酶Ⅱ核心啟動(dòng)子近端序列特異性結(jié)合DNA等;KEGG信號(hào)通路分析顯示,該蛋白集合主要富集于破骨細(xì)胞分化代謝、Wnt信號(hào)通路、T細(xì)胞受體信號(hào)通路、B細(xì)胞受體信號(hào)通路等。結(jié)論:NFATc1及其相關(guān)蛋白生物學(xué)功能具有廣泛性,其原因可能與參與多種細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路相關(guān)。
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