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          可變剪接在肺腺癌預(yù)后中的價值

          張世超; 歐陽燕; 蘭應(yīng)武; 唐福州; 胡祖權(quán); 曾柱 貴州醫(yī)科大學(xué)生物與工程學(xué)院; 貴州貴陽550025; 貴州醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院; 貴州貴陽550025

          關(guān)鍵詞:肺腫瘤 預(yù)后 肺腺癌 可變剪接 臨床結(jié)果 

          摘要:目的:探討可變剪接在肺腺癌預(yù)后中的作用。方法:在TCGA數(shù)據(jù)庫中收集474例肺腺癌組織的RNA-seq數(shù)據(jù),繪制可變剪接圖譜;通過單因素Cox回歸分析確定肺腺癌中存活相關(guān)的剪接事件,再利用最小絕對收縮模型篩選用于監(jiān)測存活的預(yù)后因子;收集5例肺腺癌患者的癌組織,采用PCR擴(kuò)增及瓊脂糖凝膠電泳檢測CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1的mRNA亞型條帶。結(jié)果:在肺腺癌中存在著大量的可變剪接事件并與預(yù)后相關(guān),包括CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1,通過生物信息學(xué)利用可變剪接事件構(gòu)建了高效的風(fēng)險預(yù)測模型;KEGG途徑分析表明,主要富集的基因與““regulation of autophagy”、“central carbon metabolism in cancer”和“cell cycle”有關(guān);5例肺腺癌患者的癌組織PCR擴(kuò)增結(jié)果顯示,可變剪接核心基因CHEK1、KIF23、FN1確實存在CHEK1-AP-19309、KIF23-AP-31390、FN1-ES-57398等剪接體。結(jié)論:可變剪接事件可作為預(yù)測肺腺癌患者臨床結(jié)果的指標(biāo),可為肺腺癌患者制定個體化治療方案提供依據(jù)。

          貴州醫(yī)科大學(xué)學(xué)報雜志要求:

          {1}引用大型常用出土文獻(xiàn)合集,可使用括注,括注應(yīng)使用不同于正文的字體。第一次應(yīng)使用全稱,第二次可使用簡稱。

          {2}縮略語文題一般不使用縮略語,正文中盡量少用。必須使用時于首次出現(xiàn)處先敘述其全稱,然后括號注出中文縮略語或英文全稱及其縮略語,后兩者間用“,”分開(如該縮略語已公知,也可不注出其英文全稱)。

          {3}應(yīng)簡明、確切,概括文章的要旨,一般不超過20個漢字,小三號黑體字。

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