阿司匹林抗人乳腺癌增殖的直接作用蛋白靶點的生物信息學(xué)分析
關(guān)鍵詞：阿司匹林 人乳腺癌 生物信息學(xué) 細(xì)胞周期 細(xì)胞分裂
摘要：目的基于生物信息學(xué)分析大量公共數(shù)據(jù)庫,探討阿司匹林抑制人乳腺癌細(xì)胞增殖的分子機制。方法利用Drug Bank 5.1.3搜索確定阿司匹林的直接靶點蛋白(DPTs),STRING在線構(gòu)建阿司匹林DPTs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)和信號通路;使用cBio Portal研究人乳腺癌中DPTs基因突變,并利用OncoPrint可視化;從TCGA數(shù)據(jù)庫下載乳腺癌與正常組織中的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),利用DECenter分析差異過表達(dá)基因,對STRING分析得到的DPTs相互關(guān)聯(lián)基因與TCGA中的差異過表達(dá)基因求交集,確認(rèn)阿司匹林抑制人乳腺癌細(xì)胞增殖的潛在靶點,并利用Gene Ontology進(jìn)行GO功能富集分析。最終通過蛋白免疫印跡實驗驗證阿司匹林抑制人乳腺癌細(xì)胞增殖的潛在靶點。結(jié)果搜索Drug Bank 5.1.3確定了11個阿司匹林DPTs,KEGG通路富集表明其中6個DPTs(EDNRA,IKBKB,NFKB2,NFKBIA,PTGS2和TP53)與癌癥發(fā)生發(fā)展有關(guān)。通過分析TCGA數(shù)據(jù)庫中乳腺癌與正常組織中的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)獲得10220個過表達(dá)差異基因,與STRING分析得到的6個阿司匹林DPTs的相互關(guān)聯(lián)基因求交集,發(fā)現(xiàn)4個基因(CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1)可能是阿司匹林抑制人乳腺癌細(xì)胞增殖的潛在靶點,其基因功能主要富集于細(xì)胞周期與細(xì)胞分裂。蛋白免疫印跡實驗結(jié)果顯示:阿司匹林可以降低人乳腺癌細(xì)胞中CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1的蛋白表達(dá)。結(jié)論CDC25C,TPX2,CDC20和PLK1可能是阿司匹林抑制人乳腺癌細(xì)胞增殖的潛在靶點,其可能通過影響細(xì)胞周期和細(xì)胞分裂發(fā)揮抗腫瘤增殖作用。
南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報雜志要求:
{1}獲得基金資助的文章應(yīng)在文章首頁地腳以“基金項目”作為標(biāo)志注明項目名稱及編號，并附項目證書復(fù)印件。
{2}本刊收到投稿后，會及時進(jìn)行送審等工作，如逾3個月無回音，作者可自行處理，請勿一稿多投. 編輯部對錄用稿件有權(quán)作技術(shù)性和文字上的修改。
{3}論文題目和各級標(biāo)題應(yīng)簡潔、準(zhǔn)確，20個字以內(nèi)為宜；避免使用非公知、公用的縮略詞及代號。
{4}參考文獻(xiàn)應(yīng)標(biāo)明所引用文獻(xiàn)的著者姓名、書名、出版地名、出版社名、出版時間、頁碼等。
{5}文稿需附加中、英文摘要和關(guān)鍵詞。中文摘要一般不超過400 字，關(guān)鍵詞5～8 個，中、英文需對應(yīng)。
注：因版權(quán)方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
