龍眼類受體蛋白激酶CRK家族全基因組鑒定及表達(dá)調(diào)控分析
關(guān)鍵詞：龍眼 crk 基因家族 鑒定 表達(dá)調(diào)控
摘要：為了解龍眼富含半胱氨酸的類受體蛋白激酶(cysteine-rich receptor-like kinase,CRK)家族的基本特征與功能,本研究采用生物信息學(xué)分析方法對篩選出的98個龍眼CRK基因家族的成員進(jìn)行分析鑒定,包括分子進(jìn)化樹的構(gòu)建和對蛋白結(jié)構(gòu)域及其特性、啟動子及其順式作用元件、體胚發(fā)生的過程以及組織器官特異性表達(dá)的分析。結(jié)果顯示:通過對龍眼和擬南芥CRK基因做進(jìn)化樹分析,可根據(jù)親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近將其分為7個亞家族;不同亞家族成員的蛋白質(zhì)特性(氨基酸數(shù)量、相對分子質(zhì)量、等電點(diǎn)、信號肽及糖基化位點(diǎn))有所不同;各成員基因結(jié)構(gòu)特性,啟動子順式作用元件,蛋白結(jié)構(gòu)域特性等與進(jìn)化樹中家族成員親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近相關(guān);98個CRK家族成員在體胚發(fā)生過程(NEC、EC、ICpEC、GE)以及生長發(fā)育過程中組織器官特異性表達(dá)情況有所不同,其中在非胚性愈傷組織以及幼果中表達(dá)量較高,在種子和果實中幾乎未表達(dá)。此外,富含半胱氨酸的類受體蛋白激酶在生物脅迫、非生物脅迫(抗病蟲害、抗旱、抗寒、抗鹽脅迫等)以及在植物生長發(fā)育過程中起著重要作用。
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