龍眼體細胞胚胎發(fā)生早期SDG基因家族的全基因組鑒定與表達分析
關鍵詞：龍眼 組蛋白賴氨酸甲基轉移酶 成員鑒定 功能分析 表觀遺傳
摘要：SET domain group(SDG)基因家族控制的組蛋白賴氨酸甲基化,是參與染色質功能調控和表觀遺傳調控基因表達的重要部分。為了解龍眼(DlSDG)家族的生物學功能,采用生物信息學分析方法進行龍眼全基因組SDG家族成員的鑒定,并對蛋白質結構域、保守基序、基因結構、啟動子順勢作用元件、進化樹、相關基因的蛋白互作和體胚發(fā)生早期的基因表達情況進行預測和分析。結果顯示,龍眼SDG家族基因包括32個成員,分為Suv、Ash、ATXR5/ATXR6、Trx、E(z)、SMYD和SETD 7個亞家族,其中Suv亞族成員數(shù)量最多;外顯子數(shù)量在1~22個不等,蛋白結構域保守,都含有一個SET結構域,DlSDG蛋白保守motif不同亞家族間差異較大;DlSDG啟動子包含許多諸如低溫、干旱和壓力等非生物脅迫響應元件和激素響應元件;龍眼SDG成員在體胚發(fā)生早期均能不同程度表達,其中DlSUVR4b在EC和ICpEC階段可能發(fā)揮著較為重要的作用;DlSUVH4可以和DNA甲基轉移酶MET1發(fā)生互作。本研究表明,龍眼DlSDG 32個組蛋白賴氨酸甲基轉移酶基因可能除了在生物鐘的調節(jié)、植物發(fā)枝數(shù)量、根的生長發(fā)育、種子的萌發(fā)、花的發(fā)育和植株的形態(tài)建成等方面發(fā)揮重要功能外,也可能直接參與脅迫響應和體細胞胚胎發(fā)生的調控,并且還可能在參與DNA甲基化、染色質重塑的過程中形成體細胞胚胎發(fā)生的協(xié)作調控網(wǎng)絡,表現(xiàn)其具有功能上的多樣性、復雜性。
熱帶作物學報雜志要求:
{1}基金項目論文：論文所涉及的課題如為國家或部、省級基金或屬攻關項目，應腳注于文題頁左下方，并附基金證書復印件。
{2}如該稿曾在學術交流會議上宣讀或在內部刊物上刊出，請在投稿時注明。
{3}文章數(shù)量關系盡量用圖表列出，圖表不超過6幅，盡可能緊隨文字之后，圖中所標字母和符號必須清晰醒目，大小適中。
{4}注釋用于對文章正文作補充論說的文字，采用頁下注，注號用①②③；參考文獻用于說明引文出處，采用文末注，用［1］［2］［3］順序標注。
{5}正文一級標題采用漢字數(shù)字“一、二、三……”形式排序；正文二級標題采用漢字數(shù)字加括號“（一）、（二）、（三）……”形式排序，正文三級標題采用阿拉伯數(shù)字“1、2、3……”形式排序，正文四級標題采用阿拉伯數(shù)字“①、②、③……”形式排序。
注：因版權方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
