利用InDel標(biāo)記分析23份黃瓜種質(zhì)的遺傳多樣性及核心種質(zhì)資源篩選
關(guān)鍵詞：黃瓜 indel標(biāo)記 核心種質(zhì) 遺傳多樣性
摘要：為了研究不同來(lái)源黃瓜的親緣關(guān)系,篩選適宜作雜交親本的種質(zhì)資源,基于黃瓜重測(cè)序開(kāi)發(fā)的InDel標(biāo)記,應(yīng)用UPGMA進(jìn)化樹(shù)聚類(lèi)、主成分分析和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析3種方法分析了23份黃瓜種質(zhì)的遺傳多樣性.結(jié)果表明:23份黃瓜種質(zhì)的遺傳相似性系數(shù)為0.23-0.95,平均值為0.56,相似性系數(shù)低于0.6的有137對(duì)組合,占全部組合的54%,說(shuō)明這些材料的遺傳多樣性較好.3種分析方法均將23份黃瓜種質(zhì)分為三大類(lèi)群:P1來(lái)源于亞洲,都屬于華南類(lèi)型黃瓜;P2來(lái)源于歐洲和美國(guó),包含歐洲類(lèi)型長(zhǎng)黃瓜、歐洲類(lèi)型短黃瓜和2個(gè)美國(guó)加工型黃瓜;P3僅包含1個(gè)來(lái)源于廣東的品種,從表型上看屬于華南類(lèi)型.P3親緣關(guān)系更接近P1,P1和P2之間遺傳差異明顯.利用InDel標(biāo)記分析的結(jié)果,對(duì)核心種質(zhì)最佳樣本量進(jìn)行了預(yù)測(cè),應(yīng)用M策略將9份黃瓜種質(zhì)確定為核心種質(zhì),包含了群體中幾乎所有的黃瓜類(lèi)型,外形上有白刺、褐刺以及光滑型,這9份核心種質(zhì)能夠很大范圍地覆蓋表型的變異.
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