結(jié)腸癌中核內(nèi)miRNA的激活調(diào)控作用研究
關(guān)鍵詞：結(jié)腸癌 核內(nèi)mirna
摘要：為了探究增強(qiáng)子介導(dǎo)的核內(nèi)miRNA在結(jié)腸癌發(fā)生中的作用,本研究篩選了結(jié)腸癌中的差異表達(dá)的miRNA數(shù)據(jù)、結(jié)腸的特異性增強(qiáng)子數(shù)據(jù)、結(jié)腸癌中差異表達(dá)基因數(shù)據(jù),利用細(xì)胞核內(nèi)miRNA靶向增強(qiáng)子預(yù)測(cè)算法,篩選miRNA調(diào)控的結(jié)腸特異性增強(qiáng)子;利用增強(qiáng)子靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù),篩選核內(nèi)miRNA調(diào)控的差異表達(dá)靶基因,并且構(gòu)建核內(nèi)miRNA-靶基因網(wǎng)絡(luò),并通過(guò)網(wǎng)絡(luò)的分析和篩選獲得結(jié)腸癌中關(guān)鍵的致病基因,同時(shí)對(duì)網(wǎng)絡(luò)中的靶基因進(jìn)行GO的功能注釋。結(jié)果表明,我們所構(gòu)建的核內(nèi)miRNA-激活調(diào)控靶基因網(wǎng)絡(luò)包含miRNA-靶基因關(guān)系對(duì)2121個(gè),259個(gè)節(jié)點(diǎn),其中包含34個(gè)下調(diào)基因、183個(gè)上調(diào)的基因,7個(gè)下調(diào)的miRNA,35個(gè)上調(diào)的miRNA。而后我們分析了網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行的節(jié)點(diǎn)度的整體分布情況,發(fā)現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)中大部分的節(jié)點(diǎn)的度都是小于10的,僅有少量miRNA結(jié)合和部分的差異表達(dá)基因節(jié)點(diǎn)的度大于10。核內(nèi)miRNA主要通過(guò)激活調(diào)控了一些應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)的功能和,同時(shí),抑制調(diào)控了細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞死亡巨噬細(xì)胞代謝等相關(guān)功能,通過(guò)激活和抑制相關(guān)功能誘發(fā)結(jié)腸癌的發(fā)生。從核內(nèi)miRNA的激活調(diào)控角度研究結(jié)腸癌的發(fā)病機(jī)制,是對(duì)原有細(xì)胞漿中miRNA抑制調(diào)控機(jī)制的補(bǔ)充,也為結(jié)腸癌的系統(tǒng)研究提供了新的視野。
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