2017年湖北省襄陽市手足口病患者柯薩奇病毒A2型分離株的突變和重組分析
關(guān)鍵詞：手足口病 柯薩奇病毒a2型 vp1基因特征 重組分析
摘要：目的通過對(duì)2016-2017年襄陽市手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)樣品的分離與鑒定,了解主要病原之一的柯薩奇病毒A2型(Coxsackievirus, CV-A2)的分子生物學(xué)特征。方法收集2016年9月-2017年12月襄陽市HFMD患兒肛拭子樣品,用人類橫紋肌肉瘤細(xì)胞(RD細(xì)胞)培養(yǎng),分離病毒。RT-PCR擴(kuò)增CV-A2 VP1基因,Megalign軟件分析VP1基因同源性,MEGA6軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。比較3種疾病(急性遲緩性麻痹、手足口病和急性呼吸道感染)CV-A2分離株VP1氨基酸序列,分析可能的致病位點(diǎn)。擴(kuò)增CV-A2代表株基因組全長序列,用SimPlot軟件分析可能的重組事件。結(jié)果 2016-2017年CV-A2襄陽株之間VP1核苷酸及氨基酸同源性分別為96.4%~99.8%,98.0%~100.0%;襄陽株與CV-A2原型株(Fleetwood株)之間的核苷酸及氨基酸同源性分別為80.8%~81.9%,95.3%~95.9%。與襄陽株同源性最高的為2017年江西株(GenBank:MG926784),核苷酸及氨基酸同源性分別為96.7%~98.8%,98.0%~98.6%。襄陽市HFMD主要病原之一的CV-A2 VP1基因系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,襄陽株與國內(nèi)主要流行株同屬于基因型D。3種疾病分離株的VP1氨基酸比對(duì)發(fā)現(xiàn),急性遲緩性麻痹分離株和HFMD分離株在第21、60、82和215位存在差異;而HFMD分離株與呼吸道感染分離株之間只在167位存在差異,由谷氨酸變成天冬氨酸。CV-A2重組分析提示,襄陽株在P1區(qū)域與Fleetwood株同屬一分支,在P2區(qū)域與CV-A5 Swartz株親緣性最高,但在P3區(qū)域與CV-A16 G-10株有較高的相似度。結(jié)論雖然CV-A2襄陽株與其他流行株在VP1區(qū)序列上親緣性較高,但其VP1氨基酸突變或與其他腸道病毒的型間重組可能導(dǎo)致其致病特性與流行病學(xué)特點(diǎn)發(fā)生變化。
微生物學(xué)免疫學(xué)進(jìn)展雜志要求:
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