1986年11月，新疆教育出版社高校教材部及其編輯人員全部劃歸新疆大學(xué)，成立新疆大學(xué)出版社。新疆大學(xué)出版社的主管單位為新疆維吾爾自治區(qū)教育廳，主辦單位為新疆大學(xué)，目前為事業(yè)單位獨立法人。

新疆大學(xué)出版社是新疆維吾爾自治區(qū)惟一的一所大學(xué)出版社。新疆大學(xué)出版社立足新疆，面向中國，竭誠為新疆高等院校的教學(xué)和科研服務(wù)，重點編輯出版高校教材、教學(xué)參考書和學(xué)術(shù)著作等，同時積極出版反映新疆科研成果、具有新疆地區(qū)與民族特色和學(xué)科特點的專著及其他圖書。

2007年10月14日至26日，新疆大學(xué)出版社組織員工去南疆五地州進行調(diào)研，考察當(dāng)?shù)亍皷|風(fēng)工程”、“農(nóng)家書屋”及雙語教育的實施情況等，并調(diào)研了南疆諸高校一些地方、民族特色教材的開發(fā)使用情況和潛在市場前景。胡信年認(rèn)為，新疆大學(xué)社是新疆唯一的大學(xué)社，應(yīng)首先將工作定位在為全疆40多所高職高專以上高校的教學(xué)與科研服務(wù)上，應(yīng)主動去找市場、爭市場。此外，新大社今后在少數(shù)民族雙語及外語教育、地方和民族特色教材開發(fā)及新疆（西域）地方歷史、地理、文化、宗教、民族、旅游、經(jīng)濟、文化等人文社科類圖書出版領(lǐng)域是可以有所作為的。

新疆大學(xué)出版社的經(jīng)營業(yè)務(wù)范圍主要是科學(xué)教育圖書出版、發(fā)行及資料翻譯等。