高油酸花生發(fā)芽期低溫脅迫轉(zhuǎn)錄組及差異表達(dá)基因分析
關(guān)鍵詞：花生 高油酸 轉(zhuǎn)錄組分析 耐寒
摘要：高油酸花生(ArachishypogaeaL.)油具有優(yōu)異的營養(yǎng)成分和熱氧化穩(wěn)定性,有利于人體健康和工業(yè)生產(chǎn)。但是高油酸花生在發(fā)芽期間對溫度比較敏感,限制了其在低溫地區(qū)的引種。為了進(jìn)一步了解高油酸花生在發(fā)芽期響應(yīng)低溫脅迫的分子機(jī)制,本研究選用田間試驗中耐寒表現(xiàn)不同的4種高油酸花生品種,分析其在發(fā)芽期低溫脅迫下的全基因組水平調(diào)控。通過轉(zhuǎn)錄組高通量測序共獲得139429條Unigene,其中兩組耐寒與不耐寒高油酸花生品種在低溫脅迫下共產(chǎn)生差異表達(dá)基因(differentially expressed gene,DEG)3520個,且耐寒花生中上調(diào)表達(dá)的DEG數(shù)目大于下調(diào)表達(dá)的數(shù)目。GO分析表明,耐寒高油酸花生中有關(guān)細(xì)胞膜代謝與完整性以及細(xì)胞外周蛋白差異表達(dá)基因的數(shù)量較多;KEGG通路分析表明,植物病原相互作用和植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路在抗寒中起著重要作用。進(jìn)一步篩選出4個低溫誘導(dǎo)蛋白基因--時鐘調(diào)控蛋白基因(TIC)、AGO4蛋白基因(AGO4)、組蛋白–賴氨酸N甲基類轉(zhuǎn)移酶ATX3基因(ATX3)、FERONIA類受體蛋白激酶基因(FER)和3個轉(zhuǎn)錄因子基因--bHLH、3R-1MYB和EREB,采用qRT-PCR檢測這些基因在低溫脅迫下的表達(dá)量。結(jié)果顯示,在低溫處理3h后TIC、ATX3和AGO4以及轉(zhuǎn)錄因子基因bHLH、MYB和EREB的表達(dá)量明顯升高,FER在脅迫12h后也有明顯升高,表明這些基因在花生萌發(fā)期響應(yīng)低溫脅迫。本研究為深入了解高油酸花生發(fā)芽期低溫脅迫轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制和篩選花生抗寒基因提供了數(shù)據(jù)資源。
遺傳雜志要求:
{1}參考文獻(xiàn)盡可能使用近5年公開發(fā)表的文獻(xiàn)，數(shù)量在10—30條，采用順序編碼制著錄，依照其在文中出現(xiàn)的先后順序用阿拉伯?dāng)?shù)字標(biāo)出，并將序號置于方括號中，排列于文后。
{2}稿件自來稿之日起三個月內(nèi)未接到本刊錄用通知，作者可自行處理。本刊對決定采用的稿件有權(quán)進(jìn)行刪改。
{3}如果能用文字簡潔說明的內(nèi)容就不必列表。圖、表按其在正文中出現(xiàn)的先后次序連續(xù)編碼,每幅圖表應(yīng)冠有圖表序號及圖題、表題。
{4}基金項目：獲得基金資助產(chǎn)出的文章應(yīng)注明基金項目名稱，并在括號內(nèi)注明其項目編號。
{5}關(guān)鍵詞是反映論文主題概念的詞或詞組，為了便于檢索，一般應(yīng)選取稿件中的關(guān)鍵性詞組，數(shù)量要適中，3~8個。
注：因版權(quán)方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
