黑素瘤與色素痣的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
許媛媛; 肖飛; 劉彥霞; 王晨; 郝永紅; 方向東; 婁曉敏; 趙華 解放軍醫(yī)學(xué)院; 北京市100853; 中國科學(xué)院北京基因組研究所; 中國人民解放軍總醫(yī)院第一醫(yī)學(xué)中心皮膚科
關(guān)鍵詞：黑素瘤 色素痣 轉(zhuǎn)錄組分析
摘要：目的分析黑素瘤與色素痣的差異表達基因,從轉(zhuǎn)錄組水平揭示黑素瘤的發(fā)病機制。方法本研究中選用4例黑素瘤和3例色素痣患者組織樣本,提取RNA后用Illumina測序平臺進行高通量測序。分析得到差異表達基因后,對其進行相關(guān)的功能聚類及相互作用分析。結(jié)果與色素痣比較,黑素瘤中表達上調(diào)的基因有249個,表達下調(diào)的基因有109個;差異表達基因功能富集分析的結(jié)果顯示,黑素瘤中表達上調(diào)的基因更多的與免疫系統(tǒng)及其調(diào)節(jié)有關(guān)。結(jié)論免疫相關(guān)基因的改變可能在黑素瘤的發(fā)展中起重要作用。
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