菌根共生網(wǎng)絡(luò)嵌套性判定的零模型選擇
關(guān)鍵詞：關(guān)系網(wǎng)絡(luò) 嵌套性 零模型 網(wǎng)絡(luò)非對(duì)稱性
摘要：零模型是判定網(wǎng)絡(luò)嵌套性的重要依據(jù),菌根共生關(guān)系網(wǎng)絡(luò)經(jīng)常出現(xiàn)高度非對(duì)稱性,該文通過(guò)探究矩陣非對(duì)稱變化對(duì)基于不同零模型構(gòu)建方法的網(wǎng)絡(luò)嵌套性的影響,試圖為非對(duì)稱網(wǎng)絡(luò)零模型的選擇提供依據(jù)。結(jié)果表明:不同零模型保守性不同,增加限定條件減少零模型構(gòu)建過(guò)程中的自由空間,高度限定條件易導(dǎo)致第II類錯(cuò)誤。高度非對(duì)稱網(wǎng)絡(luò)會(huì)增加基于完全隨機(jī)(r00)零模型的矩陣溫度(NT)偏離、降低配對(duì)重疊度(NODF)偏離,標(biāo)準(zhǔn)化指數(shù)z-score值顯示網(wǎng)絡(luò)非對(duì)稱增加后有助于NT和NODF顯著性判定。行或列限定對(duì)非對(duì)稱網(wǎng)絡(luò)嵌套性判定的影響存在差異,列限定(c0)的網(wǎng)絡(luò)嵌套性判定對(duì)網(wǎng)絡(luò)非對(duì)稱性變化的響應(yīng)規(guī)律與r00零模型的響應(yīng)趨勢(shì)基本一致,具有更低的嵌套性偏離和標(biāo)準(zhǔn)差值。行限定(r0,包括行列限定(backtrack))零模型NT值和NT偏移隨矩陣非對(duì)稱性的變化保持穩(wěn)定,較之c0零模型在高度非對(duì)稱網(wǎng)絡(luò)中呈現(xiàn)更低的NODF偏離值。選用完全隨機(jī)和限定零模型相結(jié)合的方法,有助于更加準(zhǔn)確判斷非對(duì)稱網(wǎng)絡(luò)是否具有嵌套結(jié)構(gòu)。高度非對(duì)稱網(wǎng)絡(luò)嵌套性判定中對(duì)行屬性特征比較敏感,不同非對(duì)稱性網(wǎng)絡(luò)間嵌套性水平相比較時(shí)選用r0零模型要優(yōu)于r00和c0零模型。
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